Zbývá uhradit skladování a likvidaci nepoužitých vakcín, což přijde na 4,3 milionu korun. Jediné, co se nevyhodí, jsou statisíce jehel a stříkaček, které vláda plánuje poslat do fakultních nemocnic. „Nejvíce peněz se utratilo za očkovací látky (150 milionů korun) a pět set tisíc balení léků proti chřipce (185,5 milionu korun), které se přidaly ke dvěma milionům balení, které už Česko mělo ve skladech,“ uvedl server Aktuálně.cz. Stát nakoupil léky proti chřipce, takzvaná antivirotika, i když ve skladech byly dva miliony balení těchto léků. Ke dni 27. dubna minulého roku měla ČR v zásobách 1 922 870 balení antivirotika Tamiflu a 100 000 balení antivirotika Relenza.
Na základě usnesení vlády z června 2009 zajistilo ministerstvo nákup dalších 500 000 balení antivirotika Relenza v celkové hodnotě 185 485 000 korun. Při objednávce vakcín ministerstvo zdravotnictví v jedné z variant původně uvažovalo o nákupu až 20 milionů vakcín, další variantou bylo nekoupit žádnou. Vláda schválila nákup milionu vakcín, stát odebral 700 000. Většina se podle serveru ale nikdy nepoužije. „Celkový počet očkovaných osob k datu 31. května 2010 je 68 973,“ cituje server ze závěrečné zprávy o pandemii.
Malý počet očkovaných je varující. Státu se nepodařilo k očkování přimět chronicky nemocné ani lidi důležité pro chod klíčových institucí. Očkování odmítl i prezident republiky Václav Klaus. Celková bilance viru pandemického viru H1N1 v ČR čítá 2477 laboratorně potvrzených případů z toho zemřelo 102 nakažených – většina z nich byli lidé nad 15 let s vážným doprovodným onemocněním. Ministerstvo zvažuje změnit přístup a nechat očkování jen dobrovolné vzhledem k tomu, že povinné očkování je v podstatě nevymahatelné, a to i u zdravotníků, kteří by se o nemocné s prasečí chřipkou starali.